Jedna od najvećih zbirki Muzeja je Zbirka fotografija, filmova i negativa koja obrađuje fotografiju kao muzejski predmet povijesnog razdoblja od početka 20. stoljeća do danas.
Prema vrsti materijala Zbirka je podijeljena na fotografije, filmove, negative, albume i dijapozitive.
Zbirka sadrži reportažnu ratnu fotografiju i to snimke fotografskih službi iz vremena Nezavisne Države Hrvatske (Foto ureda Državnog i promičbenog ureda kod Predsjedničtva vlade NDH, Hrvatske izvještajne službe, Promičbe i fotografa u vojnim jedinicama), kao i fotografa u fotosekcijama Propagandnog odjela ZAVNOH-a (Zemaljskog antifašističkog vijeća narodnog oslobođenja Hrvatske), Oblasnog narodnooslobodilačkog odbora Slavonije i Oblasnog narodnooslobodilačkog odbora Dalmacije.
Među fotografima čije se fotografije čuvaju u Zbirci svakako treba istaknuti Milenka Mitrakovića, Gjuru Griesbacha, Mladena Grčevića, Edmunda Stögera, Ivana Softu, Dragutina Rajtarića, Milana Pavića, Huge Fischer Ribarića, Elvire Kohn, Mladena Ivekovića, Marijana Szaba, Đure Vrkljana,Vladimira Bakarića…
Razdoblje socijalizma je zastupljeno s fotografijama obnove, izgradnje, radnih akcija, kongresa te fotografijama iz razdoblja planske privrede i tehnike.
Osamostaljenje Republike Hrvatske i Domovinski rat dokumentira više od 3000 sakupljenih fotografija koje su snimili profesionalni fotoreporteri ali i fotografi amateri sudionici ratnih zbivanja.
Kustosi Zbirke
Ivica Nevešćanin, viši kustos
Nikola Seiwerth, kustos